Linkage of <i>Vfa4</i> in <i>Malus</i> × <i>domestica</i> and <i>Malus floribunda</i> with <i>Vf</i> resistance to the apple scab pathogen <i>Venturia inaequalis</i>
Notice bibliographique
Résumé
The Vf locus from Malus floribunda clone 821 is an important source of resistance to apple scab disease caused by Venturia inaequalis , and has been introduced into numerous cultivars of domesticated apple, Malus × domestica . Cloning of the putative Vf locus has revealed that it contains several receptor‐like Vf candidate genes. In order to determine which of these genes is most closely linked to Vf resistance, primers were designed based on conserved regions in the Vf candidate genes adjacent to a variable portion of the leucine‐rich repeat (LRR) domain, to yield PCR product length polymorphisms. PCR products were obtained from 31 cultivars of M. × domestica , of which 19 are known to contain Vf resistance, and from 10 selections of M. floribunda . PCR products corresponding in size to Vfa1 and Vfa2 were found in all the plants tested. However, a PCR product with 100% predicted amino acid identity to Vfa4 was found only in M. × domestica cultivars known to have Vf scab resistance. This PCR product was also found in most, but not all, selections of M. floribunda tested, including the original source of Vf resistance, M. floribunda 821. The PCR product matching Vfa4 appears to be the most closely linked to Vf resistance and should be a valuable tool for monitoring Vf inheritance in apple.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».