MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W1999999339 · doi:10.1371/journal.pone.0053907

Evolution and Expression Plasticity of Opsin Genes in a Fig Pollinator, Ceratosolen solmsi

2013· article· en· W1999999339 sur OpenAlexaff
Bó Wáng, Jinhua Xiao, Sheng‐Nan Bian, Li‐Ming Niu, Robert W. Murphy, Da‐Wei Huang

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésOpsinPollinatorBiologyGeneEvolutionary biologyGeneticsBotanyPollinationRhodopsinRetinal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Figs and fig pollinators have co-evolved species-specific systems of mutualism. So far, it was unknown how visual opsin genes of pollinators have evolved in the light conditions inside their host figs. We cloned intact full-length mRNA sequences of four opsin genes from a species of fig pollinator, Ceratosolen solmsi, and tested for selective pressure and expressional plasticity of these genes. Molecular evolutionary analysis indicated that the four opsin genes evolved under different selective constraints. Subsets of codons in the two long wavelength sensitive opsin (LW1, LW2) genes were positively selected in ancestral fig pollinators. The ultraviolet sensitive opsin (UV) gene was under strong purifying selection, whereas a relaxation of selective constrains occurred on several amino acids in the blue opsin. RT-qPCR analysis suggested that female and male fig pollinators had different expression patterns possibly due to their distinct lifestyles and different responses to light within the syconia. Co-evolutionary history with figs might have influenced the evolution and expression plasticity of opsin genes in fig pollinators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,128 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONE→Même sujetPlant and animal studies→Travaux en français237 207→