MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2000109689 · doi:10.1210/me.2012-1182

GATA2-Induced Silencing and LIM-Homeodomain Protein-Induced Activation Are Mediated by a Bi-Functional Response Element in the Rat GnRH Receptor Gene

2012· article· en· W2000109689 sur OpenAlexfundno aff
Anne‐Laure Schang, Anne Granger, Bruno Quérat, Christian Bleux, Joëlle Cohen-Tannoudji, Jean‐Noël Laverrière

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchool of Medicine, Indiana UniversityUniversité de Rennes 1Université Paris DiderotAgence Nationale de la RechercheCentre National de la Recherche ScientifiqueUniversité Laval
Mots-clésGNRHRGATA2BiologyTranscription factorMolecular biologyEnhancerHomeoboxCell biologyGonadotropin-releasing hormoneGeneGeneticsLuteinizing hormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GATA2 transcription factor and LIM homeodomain proteins Islet1 (ISL1) and LIM homeobox 3 (LHX3) are suspected to be involved in gonadotrope cell fate and maintenance. The GnRH receptor gene (Gnrhr), crucial for gonadotrope function, is expressed in the pituitary gland from embryonic day 13.5 onward, well before LH and FSH β-subunits. This expression pattern together with the presence of WGATAR and TAAT motifs in Gnrhr promoter sequences suggests the involvement of early transcription factors in promoter activation. In this study, using a well-characterized transgenic mouse model, GATA2 was found colocalized with Gnrhr promoter activity in the pituitary. Transient transfection of Gnrhr promoter luciferase fusion constructs together with either GATA2 expression vectors or small interfering RNA in gonadotrope cell lines indicated that GATA2, which typically acts as a trans-activator, unexpectedly repressed Gnrhr promoter activity. Using DNA chromatography affinity and EMSA, we demonstrated that GATA2 operates via a response element containing a peculiar palindromic GATA motif that overlaps a critical TAAT motif involved in LHX3/ISL1 trans-activation. Indeed, despite the inhibitory action of GATA2, this element displayed a clear-cut enhancer activity in gonadotrope cells. Chromatin immunoprecipitation assays indicated that GATA2, LHX3, and ISL1 interact with a Gnrhr promoter fragment encompassing this element. The trans-repressive action of GATA2 on Gnrhr promoter activity is likely balanced or even hindered by trans-activating effects of LIM homeodomain proteins via this novel bifunctional LIM/GATA response element. Such a hierarchical interplay may contribute to finely adjust Gnrhr gene expression in gonadotrope cell lineage during pituitary development as well as in the adult animal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,842

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EndocrinologyMême sujetCongenital heart defects researchTravaux en français237 207