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Enregistrement W2000142890 · doi:10.1139/b05-161

Phylogenetic position of<i>Arabis arenicola</i>and generic limits of<i>Aphragmus</i>and<i>Eutrema</i>(Brassicaceae) based on sequences of nuclear ribosomal DNA

2006· article· en· W2000142890 sur OpenAlex
Suzanne I. Warwick, Ihsan A. Al‐Shehbaz, Connie A. Sauder

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Ecology and Taxonomy Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBotanyArabidopsisInternal transcribed spacerCladePhylogenetic treeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sequence data from the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region of 45 taxa were used to determine the phylogenetic relationship of Arabis arenicola to Arabis , Arabidopsis , Braya , and Eutrema , and that of Eutrema to the purportedly related genera Aphragmus , Lignariella , Neomartinella , Platycraspedum , Taphrospermum , and Thellungiella . Arabis arenicola was originally described as Eutrema in 1830, transferred to Arabis in 1898, and has remained in Arabis to the present, even though it is morphologically more similar to Arabidopsis, Braya, and Eutrema. Sequence data were obtained from representative taxa of Arabis, Arabidopsis, and related Boechera and Catolobus, Braya and Neotorularia, and Eutrema, Aphragmus, Lignariella, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella. The five Arabis arenicola accessions examined had ITS sequences that were identical to each other and to four Arabidopsis lyrata accessions. In both maximum parsimony and maximum likelihood analyses, Arabis arenicola fell within the Arabidopsis clade and was closely aligned with Arabidopsis lyrata. Two of six purportedly related genera were not closely related to Eutrema. Both analyses placed Lignariella within a separate well-supported clade with Aphragmus, while the other four genera, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella, fell within a well-supported clade with Eutrema. Morphology and molecular data strongly suggest transferring Arabis arenicola to Arabidopsis, expanding Aphragmus to include Lignariella, and expanding Eutrema to include Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella. New combinations in Arabidopsis and Aphragmus are proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,764
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,171
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle