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Enregistrement W2000215335 · doi:10.1139/w08-128

Functional analysis of three AHL autoinducer synthase genes in <i>Mesorhizobium loti</i> reveals the important role of quorum sensing in symbiotic nodulation

2009· article· en· W2000215335 sur OpenAlexvenueno aff
Menghua Yang, Kejing Sun, Lei Zhou, Ruifu Yang, Zengtao Zhong, Jun Zhu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAutoinducerRhizobiaQuorum sensingBiologyMesorhizobiumMicrobiologyBacteriaMutantGeneLotus japonicusSymbiosisCell biologyGeneticsBiofilm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the most important signal transduction pathways in bacteria, quorum sensing, is involved in many regulatory circuits in rhizobia, especially in the control of communication between rhizobia and their plant hosts. In this study, we identified 3 autoinducer synthase genes - mrlI1, mrlI2, and mrlI3 - in Mesorhizobium loti NZP 2213. We found that MrlI1 and MrlI2 could synthesize distinct N-acyl homoserine lactone (AHL) autoinducers in rich medium cultures, and the expression of mrlI1 was shown to be growth-phase-dependent. MrlI3 did not produce any detectable AHL molecules under the culture conditions tested. To investigate whether these AHL synthases affect nodulation, we examined the nodulation of AHL-deficient mutants on their native plant host Lotus corniculatus and found that the efficiency of nodulation of bacteria with mutations of any of these 3 synthase genes was reduced, suggesting that quorum sensing systems in M. loti may play an important role in successful establishment of rhizobium-legume symbiosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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