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Enregistrement W2000353389 · doi:10.1094/pdis-07-13-0782-pdn

First Report of Soybean Cyst Nematode (<i>Heterodera glycines</i> Ichinohe) on Soybean in the Province of Quebec, Canada

2013· article· en· W2000353389 sur OpenAlexaffabout
Benjamin Mimee, Huan Peng, Vanja Popovic, Qing Yu, Marc‐Olivier Duceppe, M.-P. Tétreault, G. Bélair

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSoybean cyst nematodeHeteroderaBiologyNematodeCultivarAgronomyPopulationNematologyShorthornEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In eastern Canada, soybean, Glycine max (L.) Merr., is the most important legume, and its cultivation is expanding to new regions as cultivars for the short growing season are developed. The soybean cyst nematode (SCN), Heterodera glycines Ichinohe, is among the most destructive pests of soybean in the world. This nematode is also under quarantine regulations in many countries, including Canada. Until now, in Canada, SCN was only reported in the province of Ontario. Since its first detection in 1988 in the southwestern part of the province (1), SCN has been found in 12 other counties. It appears that SCN has been spreading in a north and northeast direction along the St. Lawrence River. We report here the first detection of SCN in the province of Quebec. Second stage juveniles (J2) and cysts were found in St. Anicet, Quebec, Canada, in a 10-ha soybean field. Light textured soil is a characteristic of the field, the same site where Pratylenchus alleni was recently discovered (2) and where irregular patches of stunted soybean plants were observed. Morphological and molecular studies of J2 and cysts confirmed the identification of this nematode population as SCN. The J2 were typical for SCN with a body length of 393 to 428 μm, lateral fields harboring four straight lines, a well-developed stylet 23 to 25 μm long, sub-ventral base knobs with posterior slops, a tail length of 43 to 50 μm, and a hyaline part of 23 to 29 μm. Cysts were brown and lemon-shaped with a posterior protuberance, ambifenestrated, underbridged, and had a strongly developed bullae. Key morphometrics were: a cyst fenestra 40 to 57 μm long and 28 to 44 μm wide, and a vulval slit 39 to 53 μm long. All of these are coincident with those of SCN (3). Ribosomal DNA of the ITS, 18S, and D2/D3 regions, and mitochondrial COX1 gene were PCR amplified from cysts and J2s gDNA using primers ITS-F (5'-TTGATTACGTCCCTGCCCTTT-3') and ITS-R (5'-ACGAGCCGAGTGATCCACCG-3'); 18S-F (5'-TTGGATAACTGTGGTTTAACTAG-3') and 18S-R (5'-ATTTCACCTCTCACGCAACA-3'); D2A (5'-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGT-3') and D3B (5'-GACCCGTCTTGAAACACGGA-3'); and COXI-F (5'-CCTACTATGATTGGTGGTTTTGGTAATTG-3') and COX1-R (5'-GTAGCAGCAGTAAAATAAGCACG-3'), respectively, and sequenced. The nucleotide sequences were 98 to 100% similar to those of SCN found in NCBI nr database (July 2013). All the sequences have been submitted to GenBank with the following accession numbers: ITS (KF453621); 18S (KF453622); D2/D3 (KF453623); and COX1 (KF453624). Using species specific sequence characterized amplified region (SCAR) primers (4) also confirmed this was H. glycines. This is the first reported case of SCN in Quebec, Canada. The proximity of St. Anicet to the Ontario border is in accordance with the North/Northeastern dispersal hypothesis. The HG type of the SCN population will have to be determined before any resistant cultivars are deployed for the management of this pathogen in the province. References: (1) T. R. Anderson et al. Plant Dis. 72:453, 1988. (2) G. Bélair et al. Plant Dis. 97:292, 2013. (3) R. H. Mulvey. Can. J. Zool. 50:1277, 1972. (4) S. Ou et al. Nematology 10:397, 2008.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,557
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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