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Enregistrement W2000424861 · doi:10.1038/ismej.2010.57

Microbial characterization of a subzero, hypersaline methane seep in the Canadian High Arctic

2010· article· en· W2000424861 sur OpenAlexafffundabout
Thomas D. Niederberger, Nancy N. Perreault, Stephanie Tille, Barbara Sherwood Lollar, Georges Lacrampe‐Couloume, Dale T. Andersen, Charles W. Greer, Wayne H. Pollard, Lyle G. Whyte

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversity of TorontoBiotechnology Research InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Space AgencyFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill UniversityNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésBiologyArchaeaHalomonasCold seepMethaneAnaerobic oxidation of methaneEuryarchaeotaMethanogenesisExtreme environmentEnvironmental chemistryMicrobial population biologyMicrocosmTemperature gradient gel electrophoresisHalophileEcology16S ribosomal RNABacteriaChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the first microbiological characterization of a terrestrial methane seep in a cryo-environment in the form of an Arctic hypersaline (∼24% salinity), subzero (-5 °C), perennial spring, arising through thick permafrost in an area with an average annual air temperature of -15 °C. Bacterial and archaeal 16S rRNA gene clone libraries indicated a relatively low diversity of phylotypes within the spring sediment (Shannon index values of 1.65 and 1.39, respectively). Bacterial phylotypes were related to microorganisms such as Loktanella, Gillisia, Halomonas and Marinobacter spp. previously recovered from cold, saline habitats. A proportion of the bacterial phylotypes were cultured, including Marinobacter and Halomonas, with all isolates capable of growth at the in situ temperature (-5 °C). Archaeal phylotypes were related to signatures from hypersaline deep-sea methane-seep sediments and were dominated by the anaerobic methane group 1a (ANME-1a) clade of anaerobic methane oxidizing archaea. CARD-FISH analyses indicated that cells within the spring sediment consisted of ∼84.0% bacterial and 3.8% archaeal cells with ANME-1 cells accounting for most of the archaeal cells. The major gas discharging from the spring was methane (∼50%) with the low CH(4)/C(2+) ratio and hydrogen and carbon isotope signatures consistent with a thermogenic origin of the methane. Overall, this hypersaline, subzero environment supports a viable microbial community capable of activity at in situ temperature and where methane may behave as an energy and carbon source for sustaining anaerobic oxidation of methane-based microbial metabolism. This site also provides a model of how a methane seep can form in a cryo-environment as well as a mechanism for the hypothesized Martian methane plumes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,365
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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