Identification of RNA Helicase A as a Cellular Factor That Interacts with Influenza A Virus NS1 Protein and Its Role in the Virus Life Cycle
Notice bibliographique
Résumé
Influenza A virus NS1 protein has multiple functions in the infected cell during the virus life cycle. Identification of novel cellular factors that interact with NS1 and understanding their functions in virus infection are of great interest. Recombinant viruses carrying a tagged NS1 are valuable for investigation of interactions between NS1 and cellular factors in the context of virus infection. Here, we report the generation of replication-competent recombinant influenza A viruses bearing a Strep tag in the NS1 protein. Purification of a protein complex associated with Strep-tagged NS1 from virus-infected cells followed by mass spectrometry revealed a number of attractive host factors. Among them, we focused our study on RNA helicase A (RHA) in this report. Through biomedical and functional analyses, we demonstrated that RHA interacts with NS1 in an RNA-dependent manner. Knockdown of RHA resulted in a significant reduction on virus yield and polymerase activity in a minigenome assay. Our cell-free viral genome replication assay showed that viral RNA replication and transcription can be enhanced by addition of RHA, and the enhanced effect of RHA required its ATP-dependent helicase activity. In summary, we established a system to identify cellular factors that interact with NS1 protein during virus infection and furthermore demonstrated that RHA interacts with NS1 and enhances viral replication and transcription.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».