MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W200045730 · doi:10.1155/2013/676430

Hedgehog Signalling is Downregulated in Celiac Disease

2013· article· en· W200045730 sur OpenAlexvenueno aff
Rui Liang, Rupert Hinds, Helen E. Abud, Wei Cheng

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Gastroenterology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPatchedHedgehog signaling pathwayHedgehogReal-time polymerase chain reactionBiologyReverse transcription polymerase chain reactionGene expressionSonic hedgehogBiopsyInflammationInternal medicineGeneMedicinePathologyImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Celiac disease (CD) is a common autoimmune disorder of the small intestine that occurs in genetically predisposed individuals. Animal studies have suggested that the hedgehog (Hh) signalling pathway is involved in gut inflammation, injury and repair. OBJECTIVE: To examine the expression of components of the Hh signalling pathway in CD. METHODS: Children undergoing gastroscopy investigation for CD at Monash University (Victoria, Australia), and other children undergoing gastroscopy in whom small bowel pathology was not expected (ie, controls), were included in the present study. One histopathologist, who was blinded to the biopsy data, analyzed the biopsies and a diagnosis of CD was made according to standard Marsh criteria. From these samples, RNA was extracted and complementary DNA was synthesized using reverse transcription polymerase chain reaction. The levels of Hh ligand Sonic hh, Indian hh, protein patched homologue 1 (PTCH 1) and bone morphogenetic protein 4 (BMP4) messenger RNA were quantified by real-time polymerase chain reaction. Relative expression quantification was performed using the ΔΔCt method. RESULTS: Duodenal biopsies were collected from 37 children. There were 20 CD specimens and 17 normal controls. The relative expression of Sonic hh from CD patients was 58% lower than that of the controls; similarly, Indian hh expression was decreased in children with CD by 44%. Compared with controls, the expression of Hh receptor PTCH 1 decreased by 71% and the expression of the Hh target gene BMP4 by 42%. CONCLUSIONS: The expression of the Hh signalling pathway genes was consistently downregulated in untreated CD children. These results suggest that the Hh signalling pathway plays a role in the mucosal lesions encountered in CD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil0,612

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of GastroenterologyMême sujetHedgehog Signaling Pathway StudiesTravaux en français237 207