Increased proportion of KIR3DS1 homozygotes in HIV-exposed uninfected individuals
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Natural killer (NK) cell activity is increased in individuals who remain uninfected despite repeated exposures to HIV. Given that a combined major histocompatibility complex (MHC) class I and killer immunoglobulin-like receptor (KIR) KIR3D genotype has been linked to rate of HIV disease progression, we assessed whether these genotypes played a role in protection from infection. DESIGN: The study genotyped 80 HIV-exposed uninfected (EU) and 304 subjects in HIV primary infection (PI) at the MHC class IB and KIR3DS/L1 loci. METHODS: KIR3D genotyping was performed by sequence-specific primer polymerase chain reaction using two pairs of specific primers for each locus. The MHC class IB locus was typed by sequence-specific oligonucleotide polymerase chain reaction and sequencing to resolve Bw4 and Bw6 alleles and the amino acid present at position 80. RESULTS: Comparison of the genetic distribution of KIR3D, HLA Bw4 and HLA Bw4-I80 genotypes in EU versus PI subjects reveal an increased proportion of KIR3DS1 homozygotes in EU (11/80, 13.8%) compared to subjects in PI (16/304, 5.3%). Analyses of combined MHC class I and KIR3D expression show no differences between the two populations. CONCLUSIONS: Homozygosity for the activating NK receptor KIR3DS1, may contribute to the more active NK cell function observed in EU and their relative resistance to HIV infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».