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Enregistrement W2000572998 · doi:10.1039/c4mb00334a

Serum metabonomic analysis of apoE−/− mice reveals progression axes for atherosclerosis based on NMR spectroscopy

2014· article· en· W2000572998 sur OpenAlexfundno aff
Yongxia Yang, Ying Liu, Lingyun Zheng, Teng Wu, Jiangchao Li, Qianqian Zhang, Xiaoqiang Li, Fengying Yuan, Jiao Guo

Notice bibliographique

RevueMolecular BioSystems · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of British Columbia
Mots-clésTaurineValineCholineLipid metabolismMetabolomicsCarnosineInternal medicineChemistryBiochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyArteriosclerosisEndocrinologyMedicineBiologyAmino acidBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Atherosclerosis is a multifactorial and progressive disease commonly correlated with a high fat diet. The aim of this study was to identify potential biomarkers for the early diagnosis and monitoring of the progression of atherogenesis in apoE(-/-) mice using (1)H NMR-based metabonomics. The apoE(-/-) mice were split into four groups according to the duration of high fat feeding (0 w, 2 w, 4 w and 8 w), and each group possessed different pathological characteristics. Serum (1)H NMR-based metabonomics selectively captured the metabotypes that correlated with the degree of atherosclerosis, showing a time-dependent progression from the physiological to pathophysiological status. It was noted that changes in HDL, choline, taurine, glycine and glucose may be regarded as specific biomarkers of the early stage of atherosclerosis. With the progression of atherosclerosis, disorders in the metabolism of amino acids such as valine, alanine and methionine appeared when large atherosclerotic plaques existed. Multiple biochemical disorders involving lipid metabolism, energy and fatty acid metabolism were observed in the progression of atherosclerosis in apoE(-/-) mice. This study demonstrated that (1)H NMR-based metabonomics can provide biochemical information about the progression of atherogenesis and offer a non-invasive means to discover potential biomarkers for the onset and development of atherosclerosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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