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Enregistrement W2000847463 · doi:10.1134/s0026261709060034

Involvement of alkylhydroxybenzenes, microbial autoregulators, in controlling the expression of stress regulons

2009· article· en· W2000847463 sur OpenAlexfundno aff
N. A. Golod, Н. Г. Лойко, К. В. Лобанов, А. С. Миронов, T. A. Voieikova, В. Ф. Гальченко, Yu. A. Nikolaev, Г. И. Эль-Регистан

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics
Mots-clésRegulonrpoSBacillus subtilislac operonReversionOperonStrain (injury)GeneEscherichia coliGene expressionBiologyChemistryGeneticsMolecular biologyBacteriaPhenotypePromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alkylhydroxybenzenes (AHB) were found to control the activation of protective functions of microorganisms by inducing stress gene expression and increasing the frequency of the intrapopulation phase transitions which are responsible for the phenotypic variability of bacteria. We established the dependence of the regulatory effects of AHB on their structure (alkyl radical length) and concentration. A reversion assay using the tryptophan auxotrophic strain Bacillus subtilis trpA5 B 1733 indicated a relationship between the reversion frequency that was 40–120 times higher than the background value and phase transition’s intensity (with R → S transition rates up to 87% in contrast to 2% in the control experiment) induced by specific doses (5–100 mg/ml) of long-chain AHB such as C 12 -AHB acting for a short time (1 h) on vegetative (dividing or stationary-phase) B. subtilis cells. Using four test strains constructed from Escherichia coli C600 thi, thr, leu Δ (pro-lac) with transcriptional or translational vectors containing the hybrid umuD-lacZ or osmE-lacZ operons, we demonstrated that AHB perform the regulatory functions involved in controlling the SOS response gene expression and the general rpoS -dependent stationary-phase regulon, respectively. The dose-dependent effect of long-chain AHB (within the 50–100 µg/ml range) resulting in a two- to threefold increase in the stress gene expression, similar to the effect of natural stress factors such as UV irradiation and starvation, provides evidence that AHB function as alarmones (danger signals). From the fact that the osm E gene is upregulated by 35–70 µg/ml C 12 -AHB (its regulation level is increased up to twofold), it follows that C 12 -AHB controls rpoS -dependent regulation and the transition to the stationary phase. The effect of the short-chain homologue C 7 -AHB substantially differs from that of C 12 -AHB. C 7 -AHB in concentrations of 10–100µg/ml causes a significant decrease in osmE and umuD expression. A 30-min preincubation of cells with 10–100µg/ml C 7 -AHB protected them from UV irradiation, as was observed as a 3.6-fold decrease in umuD expression. Comparative analysis of the marker gene’s expression values in the strains with the transcriptional and translational vectors demonstrates that AHB nonspecifically activate stress regulons at the transcription level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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