MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2000888208 · doi:10.1139/w08-129

Genetic and phenotypic diversity of geographically different isolates of<i>Glomus mosseae</i>

2009· article· en· W2000888208 sur OpenAlexvenueno aff
Luciano Avio, Caterina Cristani, Patrizia Strani, Manuela Giovannetti

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlomusBiologyGenetic diversityPhenotypeGenetic variationBotanyGeneticsGenePopulationSpore

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this work, we combined morphological taxonomy and molecular methods to investigate the intraspecific diversity of Glomus mosseae, whose global distribution has been reviewed by a survey of scientific literature and Web-available records from international germplasm collections (International Culture Collection of Vesicular Arbuscular Mycorrhizal Fungi and International Bank of Glomeromycota). We surveyed 186 publications reporting the occurrence of G. mosseae from at least 474 different sites from 55 countries throughout all continents, producing a geographical map of their distribution. The relationships among G. mosseae isolates originating from Europe (United Kingdom), the United States (Arizona, Florida, and Indiana), Africa (Namibia), and West Asia (Syria) were analyzed. The level of resolution of internal transcribed spacer (ITS) sequences strongly supports the morphological species definition of G. mosseae. An ITS - restriction fragment length polymorphism assay with the enzyme HinfI yielded a unique profile for all G. mosseae isolates, allowing a straightforward identification of this morphospecies. Genetic variability among G. mosseae isolates was revealed by the inter-simple-sequence repeat (ISSR) - polymerase chain reaction: the magnitude of genetic divergence shown by the investigated geographical isolates was higher than 50%, consistent with previous data on vegetative compatibility and functional diversity. The variability of ISSR patterns suggests that intraspecific diversity is much higher than that foreseen by morphology and rDNA regions, and should be further investigated by using other genes, such as those related to functional diversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,165
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetMycorrhizal Fungi and Plant InteractionsTravaux en français237 207