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Enregistrement W2001021554 · doi:10.1118/1.4894989

Poster — Thur Eve — 03: Application of the non‐negative matrix factorization technique to [<sup>11</sup>C]‐DTBZ dynamic PET data for the early detection of Parkinson's disease

2014· article· en· W2001021554 sur OpenAlexaff
Dong‐Chang Lee, Hans Jans, W. R. Wayne Martin, Marguerite Wieler, Sandy McEwan, Terence Riauka

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensCancerCare ManitobaUniversity of AlbertaAlberta Health Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNon-negative matrix factorizationStriatumMetric (unit)Parkinson's diseasePattern recognition (psychology)Artificial intelligenceComputer scienceMathematicsNuclear medicineMatrix (chemical analysis)Matrix decompositionChemistryPhysicsMedicineInternal medicineChromatographyDiseaseDopamine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this work, a class of non‐negative matrix factorization (NMF) technique known as alternating non‐negative least squares, combined with the projected gradient method, is used to analyze twenty‐five [11C]‐DTBZ dynamic PET/CT brain data. For each subject, a two‐factor model is assumed and two factors representing the striatum (factor 1) and the non‐striatum (factor 2) tissues are extracted using the proposed NMF technique and commercially available factor analysis software “Pixies”. The extracted factor 1 and 2 curves represent the binding site of the radiotracer and describe the uptake and clearance of the radiotracer by soft tissues in the brain, respectively. The proposed NMF technique uses prior information about the dynamic data to obtain sample time‐activity curves representing the striatum and the non‐striatum tissues. These curves are then used for “warm” starting the optimization. Factor solutions from the two methods are compared graphically and quantitatively. In healthy subjects, radiotracer uptake by factors 1 and 2 are approximately 35–40% and 60–65%, respectively. The solutions are also used to develop a factor‐based metric for the detection of early, untreated Parkinson's disease. The metric stratifies healthy subjects from suspected Parkinson's patients (based on the graphical method). The analysis shows that both techniques produce comparable results with similar computational time. The “semi‐automatic” approach used by the NMF technique allows clinicians to manually set a starting condition for “warm” starting the optimization in order to facilitate control and efficient interaction with the data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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