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Enregistrement W2001043328 · doi:10.1139/w04-095

Deletion of the <i>Candida</i> <i>albicans</i> G-protein-coupled receptor, encoded by <i>orf19.1944</i> and its allele <i>orf19.9499</i> , produces mutants defective in filamentous growth

2004· article· en· W2001043328 sur OpenAlexvenueno aff
Patrick A. Sullivan, Peter C. Farley

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésFilamentationMutantCandida albicansBiologyGeneSaccharomyces cerevisiaeCorpus albicansGerm tubeFungal proteinGene productGeneticsMolecular biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Filamentous growth of Candida albicans occurs in response to a variety of environmental signals. The C. albicans gene orf19.1944 and its allele orf19.9499 are identical and are predicted to encode an 823-residue, 7-transmembrane-domain protein that has all the expected features of a G-protein-coupled receptor. The protein is 20.9% identical to the Saccharomyces cerevisiae Gpr1p receptor that signals both glucose availability and nitrogen limitation. Deletion of both copies of the gene in C. albicans abolished filamentation by colonies embedded in rich media (YPS, YPGal, and YPGlu), whereas mutants carrying a single copy of the gene were indistinguishable from the parental strain under these conditions. On medium containing low concentrations of ammonia (SLAD and SLAM media), surface colonies of both the homozygous deletion mutants and the mutants carrying a single copy of the gene were defective in filamentation. Serum-induced germ tube formation was unaffected by deletion of this gene, as was filamentation of the mutants growing on the surface of solid Spider medium at 37 degrees C or embedded in solid Spider medium at 25 degrees C. The protein encoded by orf19.1944 and orf19.9499 has a role in filamentation by both surface and embedded colonies, presumably as a sensor of environmental cues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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