Deletion of the <i>Candida</i> <i>albicans</i> G-protein-coupled receptor, encoded by <i>orf19.1944</i> and its allele <i>orf19.9499</i> , produces mutants defective in filamentous growth
Notice bibliographique
Résumé
Filamentous growth of Candida albicans occurs in response to a variety of environmental signals. The C. albicans gene orf19.1944 and its allele orf19.9499 are identical and are predicted to encode an 823-residue, 7-transmembrane-domain protein that has all the expected features of a G-protein-coupled receptor. The protein is 20.9% identical to the Saccharomyces cerevisiae Gpr1p receptor that signals both glucose availability and nitrogen limitation. Deletion of both copies of the gene in C. albicans abolished filamentation by colonies embedded in rich media (YPS, YPGal, and YPGlu), whereas mutants carrying a single copy of the gene were indistinguishable from the parental strain under these conditions. On medium containing low concentrations of ammonia (SLAD and SLAM media), surface colonies of both the homozygous deletion mutants and the mutants carrying a single copy of the gene were defective in filamentation. Serum-induced germ tube formation was unaffected by deletion of this gene, as was filamentation of the mutants growing on the surface of solid Spider medium at 37 degrees C or embedded in solid Spider medium at 25 degrees C. The protein encoded by orf19.1944 and orf19.9499 has a role in filamentation by both surface and embedded colonies, presumably as a sensor of environmental cues.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».