Synthesis of paucimannose N-glycans by Caenorhabditis elegans requires prior actions of UDP-N-acetyl-d-glucosamine:alpha-3-d-mannoside beta1,2-N-acetylglucosaminyltransferase I, alpha3,6-mannosidase II and a specific membrane-bound beta-N-acetylglucosaminidase
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
We have previously reported three Caenorhabditis elegans genes ( gly-12, gly-13 and gly-14 ) encoding UDP- N -acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta1,2- N -acetylglucosaminyltransferase I (GnT I), an enzyme essential for hybrid and complex N-glycan synthesis. GLY-13 was shown to be the major GnT I in worms and to be the only GnT I cloned to date which can act on [Manalpha1,6(Manalpha1,3)Manalpha1,6](Manalpha1,3)Manbeta1, 4GlcNAcbeta1,4GlcNAc-R, but not on Manalpha1,6(Manalpha1,3)Manbeta1- O -R substrates. We now report the kinetic constants, bivalent-metal-ion requirements, and optimal pH, temperature and Mn(2+) concentration for this unusual enzyme. C. elegans glycoproteins are rich in oligomannose (Man(6-9)GlcNAc(2)) and 'paucimannose' Man(3-5)GlcNAc(2)(+/-Fuc) N-glycans, but contain only small amounts of complex and hybrid N-glycans. We show that the synthesis of paucimannose Man(3)GlcNAc(2) requires the prior actions of GnT I, alpha3,6-mannosidase II and a membrane-bound beta- N -acetylglucosaminidase similar to an enzyme previously reported in insects. The beta- N -acetylglucosaminidase removes terminal N -acetyl-D-glucosamine from the GlcNAcbeta1, 2Manalpha1,3Manbeta- arm of Manalpha1,6(GlcNAcbeta1,2Manalpha1,3) Manbeta1,4GlcNAcbeta1,4GlcNAc-R to produce paucimannose Man(3)GlcNAc(2) N-glycan. N -acetyl-D-glucosamine removal was inhibited by two N -acetylglucosaminidase inhibitors. Terminal GlcNAc was not released from [Manalpha1,6(Manalpha1,3)Manalpha 1,6] (GlcNAcbeta1,2Manalpha1,3)Manbeta1,4GlcNAcbeta1,4GlcNAc-R nor from the GlcNAcbeta1,2Manalpha1,6Manbeta- arm. These findings indicate that GLY-13 plays an important role in the synthesis of N-glycans by C. elegans and that therefore the worm should prove to be a suitable model for the study of the role of GnT I in nematode development.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle