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Enregistrement W2001107896 · doi:10.1093/glycob/cwu123

Crystal structure of the HIV neutralizing antibody 2G12 in complex with a bacterial oligosaccharide analog of mammalian oligomannose

2014· article· en· W2001107896 sur OpenAlex
Robyn L. Stanfield, Cristina De Castro, Alberto M Marzaioli, Ian A. Wilson, Ralph Pantophlet

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchOffice of ScienceNational Cancer InstituteInternational AIDS Vaccine InitiativeNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCU.S. Department of Energy
Mots-clésEpitopeHIV vaccineGlycoconjugateVirologyGlycoproteinAntibodyNeutralizing antibodyChemistryOligosaccharideAntigenGlycanBiologyVirusHuman immunodeficiency virus (HIV)BiochemistryImmunologyVaccine trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) is a major public health threat that continues to infect millions of people worldwide each year. A prophylactic vaccine remains the most cost-effective way of globally reducing and eliminating the spread of the virus. The HIV envelope spike, which is the target of many vaccine design efforts, is densely mantled with carbohydrate and several potent broadly neutralizing antibodies to HIV-1 recognize carbohydrate on the envelope spike as a major part of their epitope. However, immunizing with recombinant forms of the envelope glycoprotein does not typically elicit anti-carbohydrate antibodies. Thus, studies of alternative antigens that may serve as a starting point for carbohydrate-based immunogens are of interest. Here, we present the crystal structure of one such anti-carbohydrate HIV neutralizing antibody (2G12) in complex with the carbohydrate backbone of the lipooligosaccharide from Rhizobium radiobacter strain Rv3, which exhibits a chemical structure that naturally mimics the core high-mannose carbohydrate epitope of 2G12 on HIV-1 gp120. The structure described here provides molecular evidence of the structural homology between the Rv3 oligosaccharide and highly abundant carbohydrates on the surface of HIV-1 and raises the potential for the design of novel glycoconjugates that may find utility in efforts to develop immunogens for eliciting carbohydrate-specific neutralizing antibodies to HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,939

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle