Developmental Characterization of the MicroRNA-Specific C. elegans Argonautes alg-1 and alg-2
Notice bibliographique
Résumé
The genes alg-1 and alg-2 (referred to as "alg-1/2") encode the Argonaute proteins affiliated to the microRNA (miRNA) pathway in C. elegans. Bound to miRNAs they form the effector complex that effects post-transcriptional gene silencing. In order to define biological features important to understand the mode of action of these Argonautes, we characterize aspects of these genes during development. We establish that alg-1/2 display an overlapping spatio-temporal expression profile and shared association to a miRNAs set, but with gene-specific predominant expression in various cells and increased relative association to defined miRNAs. Congruent with their spatio-temporal coincidence and regardless of alg-1/2 drastic post-embryonic differences, only loss of both genes leads to embryonic lethality. Embryos without zygotic alg-1/2 predominantly arrest during the morphogenetic process of elongation with defects in the epidermal-muscle attachment structures. Altogether our results highlight similarities and specificities of the alg-1/2 likely to be explained at different cellular and molecular levels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».