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Enregistrement W2001254827 · doi:10.1080/07060660009500470

Detecting<i>Xanthomonas axonopodis</i>pv.<i>manihotis</i>in cassava true seeds by nested polymerase chain reaction assay

2000· article· en· W2001254827 sur OpenAlex
Sandra S. Ojeda, Valérie Verdier

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolymerase chain reactionNested polymerase chain reactionBacterial blightBiologyPathogenGermplasmInoculationXanthomonasSowingBacterial diseaseHorticultureMicrobiologyBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cassava bacterial blight, caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam), is a particularly destructive disease in South America and Africa. Because of quarantine procedures, international exchange of cassava germplasm is limited and occurs through true seeds or material propagated in vitro. The success of a cassava-seed certification program depends on the availability of reliable tests to detect the pathogen in true seeds and vegetative planting materials. We developed a nested polymerase chain reaction assay to detect the pathogen in cassava true seeds. The internal primers directed the amplification of a fragment of 509 base pairs in all 12 Xam strains tested, whereas no amplification product was obtained from any of the 17 strains of other Xanthomonas pathovars tested. Nested polymerase chain reaction worked well for Xam detection from cultured cells from artificially inoculated seeds and naturally infected seeds. The best detection level allowed to detect a presence as low as one to two viable cells per reaction. This technique was specific, sensitive, and rapid for detecting Xam in cassava true seeds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,909
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle