Influenza A Infection of Primary Human Airway Epithelial Cells Up-Regulates Proteins Related to Purine Metabolism and Ubiquitin-Related Signaling
Notice bibliographique
Résumé
Virus-host interactions are important determinants of virus replication and immune responses, but they are not well-defined. In this study we analyzed quantitative host protein alterations in nuclei-enriched fractions from multiple primary human bronchial airway epithelial (HBAE) cells infected by an H1N1 influenza A virus (A/PR/8/34). We first developed an effective detergent-free nuclear lysis method that was coupled with in-solution digestion and LC-MS/MS. Using SILAC, we identified 837 HBAE nuclear proteins in three different donors and compared their responses to infection at 24 h. Some proteins were altered in all three donors, of which 94 were up-regulated and 13 were down-regulated by at least 1.5-fold. Many of these up-regulated proteins clustered into purine biosynthesis, carbohydrate metabolism, and protein modification. Down-regulated proteins were not associated with any specific pathways or processes. These findings further our understanding of cellular processes that are altered in response to influenza in primary epithelial cells and may be beneficial in the search for host proteins that may be targeted for antiviral therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».