The Conserved CPH Domains of Cul7 and PARC Are Protein-Protein Interaction Modules That Bind the Tetramerization Domain of p53
Notice bibliographique
Résumé
Cul7 is a member of the Cullin Ring Ligase (CRL) family and is required for normal mouse development and cellular proliferation. Recently, a region of Cul7 that is highly conserved in the p53-associated, Parkin-like cytoplasmic protein PARC, was shown to bind p53 directly. Here we identify the CPH domains (conserved domain within Cul7, PARC, and HERC2 proteins) of both Cul7 and PARC as p53 interaction domains using size exclusion chromatography and NMR spectroscopy. We present the first structure of the evolutionarily conserved CPH domain and provide novel insight into the Cul7-p53 interaction. The NMR structure of the Cul7-CPH domain reveals a fold similar to peptide interaction modules such as the SH3, Tudor, and KOW domains. The p53 interaction surface of both Cul7 and PARC CPH domains was mapped to a conserved surface distinct from the analogous peptide-binding regions of SH3, KOW, and Tudor domains, suggesting a novel mode of interaction. The CPH domain interaction surface of p53 resides in the tetramerization domain and is formed by residues contributed by at least two subunits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».