Analyses of CIA5, the master regulator of the carbon-concentrating mechanism in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>, and its control of gene expression
Notice bibliographique
Résumé
In numerous studies, the CIA5 gene of Chlamydomonas reinhardtii Dangeard has been shown to control the expression of several "CO 2 -responsive genes" when cells are shifted to higher or lower levels of CO 2 . Using DNA microarray analyses with arrays containing 2764 unique cDNA sequences, we have demonstrated that several additional genes are controlled by the CIA5 gene, some increasing in expression when CO 2 levels are lowered and others decreasing. Not all genes that respond to changes in CO 2 concentrations are controlled by CIA5. For example, the RH1 gene, is markedly induced when both wild-type and cia5 mutant cells are shifted to high levels of CO 2 . We demonstrate that cycloheximide (an inhibitor of cytoplasmic protein synthesis) has no apparent effect on the initial induction of CO 2 -responsive genes, suggesting constitutive presence of all the molecular machinery needed by the cell to immediately respond to changes in CO 2 levels. This observation is consistent with our earlier suggestions that CIA5 or another key component(s) of the carbon-concentrating mechanism must be rapidly "activated" (or "inactivated") as part of the response of C. reinhardtii to changes in external CO 2 levels. We present new, direct evidence that CIA5 is localized to the nucleus in both low- and high-CO 2 conditions.Key words: CIA5, CCM, carbon-concentrating mechanism, photosynthesis, gene regulation, Chlamydomonas reinhardtii, CO 2 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».