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Enregistrement W2001577165 · doi:10.1139/w06-116

Purification and partial amino acid sequence of thuricin S, a new anti-<i>Listeria</i>bacteriocin from Bacillus thuringiensis

2007· article· en· W2001577165 sur OpenAlexvenueno aff
Sonia Chehimi, François Delalande, Sophie Sablé, Mohamed-Rabeh Hajlaoui, Alain Van Dorsselaer, Férid Limam, Anne‐Marie Pons

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacillus thuringiensisBacteriocinEdman degradationBacillalesBiologyBacillaceaePeptide sequenceMicrobiologyAmino acidBacillus cereusStrain (injury)ChromatographyProteinase KChemistryBacteriaBiochemistryBacillus subtilisEnzymeAntimicrobial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the isolation and characterization of a new bacteriocin, thuricin S, produced by the Bacillus thuringiensis subsp. entomocidus HD198 strain. This antibacterial activity is sensitive to proteinase K, is heat-stable, and is stable at a variety of pH values (3-10.5). The monoisotopic mass of thuricin S purified by high performance liquid chromatography, as determined with mass spectrometry ESI-TOF-MS, is 3137.61 Da. Edman sequencing and NanoESI-MS/MS experiments provided the sequence of the 18 N-terminal amino acids. Interestingly, thuricin S has the same N-terminal sequence (DWTXWSXL) as bacthuricin F4 and thuricin 17, produced by B. thuringiensis strains BUPM4 and NEB17, respectively, and could therefore be classified as a new subclass IId bacteriocin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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