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Enregistrement W2001732218 · doi:10.1139/g03-072

DNA polymorphism in the stem nematode <i>Ditylenchus dipsaci</i>: development of diagnostic markers for normal and giant races

2003· article· en· W2001732218 sur OpenAlexvenueno aff
Magali Esquibet, Éric Grenier, Olivier Plantard, F. Abbad Andaloussi, G. Caubel

Notice bibliographique

RevueGenome · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National de la Recherche Agronomique
Mots-clésBiologyAmplified fragment length polymorphismNematodeGeneticsPolymorphism (computer science)PopulationIntraspecific competitionGenetic markerBotanyAlleleGeneZoologyGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA polymorphism in the Ditylenchus dipsaci complex was investigated using amplified fragment length polymorphism (AFLP) to determine the relationships among populations growing mainly on Vicia faba and to develop diagnostic markers. Twenty-two populations of D. dipsaci originating from different geographical areas and one population of Ditylenchus myceliophagus were used. AFLP proved to be a powerful method to reveal intraspecific polymorphism even within the giant type. The analysis showed a clear distinction between the giant and normal populations, with genetic distances similar to those observed between normal populations and D. myceliophagus or giant populations and D. myceliophagus, strengthening the hypothesis that these two nematode types could be considered distinct species. Two specific AFLP markers differentiating the two types were converted into sequenced characterized amplified region (SCAR) markers. Used in a multiplex PCR, the SCAR primers proved to be a rapid and efficient tool to identify the giant and the normal types of D. dipsaci.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,122

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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