First Report of the Root-Rot Pathogen, <i>Armillaria nabsnona</i>, from Hawaii
Notice bibliographique
Résumé
The genus Armillaria (2) and Armillaria mellea sensu lato (3) have been reported previously from Hawaii. However, Armillaria species in Hawaii have not been previously identified by DNA sequences, compatibility tests, or other methods that distinguish currently recognized taxa. In August 2005, Armillaria rhizomorphs and mycelial bark fans were collected from two locations on the island of Hawaii. Stands in which isolates were collected showed moderate to heavy tree mortality and mycelial bark fans. Pairing tests (4) to determine vegetative compatibility groups revealed three Armillaria genets (HI-1, HI-7, and HI-9). Rhizomorphs of genet HI-1 were collected from both dead and healthy mature trees of the native 'Ohia Lehua (Metrosideros polymorpha) approximately 27 km west of Hilo, HI (approximately 19°40'49″N, 155°19'24″W, elevation 1,450 m). Rhizomorphs of HI-7 and HI-9 were collected, respectively, from dead/declining, mature, introduced Nepalese alder (Alnus nepalensis) and from an apparently healthy, mature, introduced Chinese banyan (Ficus microcarpa) in the Waipi'o Valley (approximately 20°03'29″N, 155°37'35″W, elevation 925 m). On the basis of somatic pairing tests and intergenic spacer-1 (IGS-1) nucleotide sequence identities of 99 to 100% with North American A. nabsnona (GenBank Accession No. AY509178), HI-1 (GenBank Accession No. DQ995356), HI-7 (GenBank Accession No. DQ995358), and HI-9 (GenBank Accession No. DQ995359) were identified as A. nabsnona, a pathogen of hardwoods (1). The IGS-1 sequences of A. nabsnona genets (HI-1, HI-7, and HI-9) had a greater similarity to North American collections of A. nabsnona than to the Asian A. nabsnona, even though the two introduced hosts originated from Asia. Phylogeographic studies could help determine the potential introduction and original source of A. nabsnona in Hawaii. Although A. nabsona was isolated from multiple hosts in declining stands, pathogenicity studies are needed to confirm whether this pathogen causes disease on diverse native and exotic tree species in Hawaii. References: (1) E. Allen et al. Pages 2-7 in: Common Tree Diseases of British Columbia. Natural Resources Canada. Canadian Forest Service, Victoria, BC, Canada, 1998. (2) D. E. Hemmes and D. E. Desjardin. Pages 129 and 153 in: Mushrooms of Hawaii. Ten Speed Press, Berkeley, CA, 2002. (3) F. F. Laemmlen and R. V. Bega. Plant Dis. Rep. 58:102, 1974. (4) Y. Wu et al. USDA Forest Service Tech. Rep. R2-58, 1996.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».