Transcriptional regulation of the<i>Enterobacter cloacae</i>UW4 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase gene (<i>acdS</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Based on DNA sequence analysis and 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase activity, the region of DNA immediately upstream of the Enterobacter cloacae UW4 ACC deaminase gene (acdS) contains several features that appear to be involved in its transcriptional regulation. In the present study, the 5' upstream region of acdS was cloned into the promoter-probe vector, pQF70, which carries the promoterless luciferase gene (luxAB), and luciferase expression was monitored. The data obtained from studying the expression of the luciferase gene showed that (i) a leucine responsive regulatory protein (LRP)-like protein encoded within the upstream region is located on the opposite strand from acdS under the control of a promoter stronger than the one responsible for acdS transcription, (ii) luciferase gene expression required both ACC and the LRP-like protein, (iii) luciferase expression was increased three-fold under anaerobic conditions, consistent with the involvement of a fumarate-nitrate reduction (FNR)-like regulatory protein box within the upstream region, and (iv) the addition of leucine to the growth medium decreased luciferase activity in the presence of ACC and increased luciferase activity in the absence of ACC, consistent with leucine acting as a regulator of the expression of the LRP-like protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».