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Enregistrement W2001814602 · doi:10.1117/12.2043155

Model predictions for the WAXS signals of healthy and malignant breast duct biopsies

2014· article· en· W2001814602 sur OpenAlexaff
R. J. LeClair

Notice bibliographique

RevueProceedings of SPIE, the International Society for Optical Engineering/Proceedings of SPIE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueRadiation Shielding Materials Analysis
Établissements canadiensLaurentian University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésScatteringAnalytical Chemistry (journal)CrystallographyNuclear magnetic resonanceChemistryPhysicsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A wide-angle x-ray scatter (WAXS) measurement could potentially be used to determine whether a biopsy of a breast duct is healthy or malignant. A ductal carcinoma in situ (DCIS) occurs when the epithelial cells lining the wall start to replicate and invade the duct interior. Since cells are composed mainly of water a WAXS signal of DCIS could contain a larger component due to water. A model approximates that a breast duct biopsy consists of connective tissue (c.t.) and cells. For a 2 mm diameter 3.81 mm thick healthy duct biopsy, the volumes in cubic mm are 11.56 c.t. and 0.41 cells whereas 6.64 c.t. and 5.33 cells for DCIS. The differential linear scattering coefficients (μs) for both types of biopsies were calculated using the sum vc.t.μsc.t. + vcellμscell where v denotes fractional volume. The cell was assumed to be composed of water, lipids (fat), and other atoms associated with RNA, DNA, proteins, and carbohydrates. The μscell was calculated using the sum 0.771μswater + 0.023μsfat + 0.206μsother. The μs of c.t., water, and fat were available from literature whereas the independent atomic model approximation was used to calculate values for μsother. A WAXS model provided predictions of the number of 6 degree scattered photons Ns for incident 50 kV beams on healthy and malignant ducts. The sum of Ns between 31.5 ≤ E ≤ 45 keV were 1402 and 1529 for respectively the healthy and malignant biopsies. Using Poisson statistics, two Gaussian distributions, and a descision threshold set at their intersection, the false positive and false negative probabilities were 4.7% and 5.0%. This work suggests that DCIS could potentially be diagnosed via energy dispersive WAXS measurements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
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