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Enregistrement W2001857143 · doi:10.1002/hep.21464

Regulation of the UGT1A1 bilirubin-conjugating pathway: Role of a new splicing event at the UGT1A locus

2006· article· en· W2001857143 sur OpenAlexaff
Éric Lévesque, Hugo Girard, Kim Journault, Johanie Lépine, Chantal Guillemette

Notice bibliographique

RevueHepatology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Health and Biochemistry
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformAlternative splicingImmunoprecipitationBiologyExonHEK 293 cellsLocus (genetics)RNA splicingBlotWestern blotBiochemistryMolecular biologyPregnane X receptorGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: UDP-glucuronosyltransferase 1A1 (UGT1A1) is involved in a wide range of biological and pharmacological processes because of its critical role in the conjugation of a diverse array of endogenous and exogenous compounds. We now describe a new UGT1A1 isoform, referred to as isoform 2 (UGT1A1_i2), encoded by a 1495-bp complementary DNA isolated from human liver and generated by an alternative splicing event involving an additional exon found at the 3' end of the UGT1A locus. The N-terminal portion of the 45-kd UGT1A1_i2 protein is identical to UGT1A1 (55 kd, UGT1A1_i1); however, UGT1A1_i2 contains a unique 10-residue sequence instead of the 99-amino acid C-terminal domain of UGT1A1_i1. RT-PCR and Western blot analyses with a specific antibody against UGT1A1 indicate that isoform 2 is differentially expressed in liver, kidney, colon, and small intestine at levels that reach or exceed, for some tissues, those of isoform 1. Western blots of different cell fractions and immunofluorescence experiments indicate that UGT1A1_i1 and UGT1A1_i2 colocalize in microsomes. Functional enzymatic data indicate that UGT1A1_i2, which lacks transferase activity when stably expressed alone in HEK293 cells, acts as a negative modulator of UGT1A1_i1, decreasing its activity by up to 78%. Coimmunoprecipitation of UGT1A1_i1 and UGT1A1_i2 suggests that this repression may occur via direct protein-protein interactions. CONCLUSION: Our results indicate that this newly discovered alternative splicing mechanism at the UGT1A locus amplifies the structural diversity of human UGT proteins and describes the identification of an additional posttranscriptional regulatory mechanism of the glucuronidation pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations95
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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