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Enregistrement W2001860779 · doi:10.3899/jrheum.130191

Aberrant CpG Islands’ Hypermethylation of ABCB1 in Mesenchymal Stem Cells of Patients with Steroid-associated Osteonecrosis

2013· article· en· W2001860779 sur OpenAlexvenueno aff
Zhibo Sun, Shuhua Yang, Shunan Ye, Yukun Zhang, Weihua Xu, Bo Zhang, Xianzhe Liu, Fengbo Mo, Wenbin Hua

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Joint Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMedicineMesenchymal stem cellCpG siteDNA methylationCancer researchPathologyGeneGeneticsGene expressionBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Patients carrying an ABCB1 polymorphism have a higher risk of developing osteonecrosis of the femoral head (ONFH). We investigated whether aberrant dinucleotide CpG islands' hypermethylation of ABCB1 gene existed in mesenchymal stem cells (MSC) of patients with ONFH, which results in cell dysfunction. METHODS: Bone marrow was collected from the proximal femur of patients with glucocorticoid (GC)-associated ONFH (n = 22) and patients with new femoral neck fractures (n = 25). MSC were isolated by density gradient centrifugation. We investigated cell viability, intracellular reactive oxygen species (ROS) level, mitochondrial membrane potential (MMP), the amount of P-glycoprotein (P-gp) and ABCB1 transcripts, and methylation at CpG islands of ABCB1 promoter from both the femoral neck fractures group and the GC-associated ONFH group treated with or without the DNA methyltransferase inhibitor, 5'-Aza-2-deoxycytidine (5'-Aza-dC). RESULTS: We observed that MSC from GC-associated ONFH groups showed reduced proliferation ability, elevated ROS levels, and depressed MMP when compared with the other 2 groups. Low levels of P-gp and ABCB1 transcript, as well as ABCB1 gene hypermethylation, in patients with GC-associated ONFH were also noted. Treatment with 5'-Aza-dC rapidly restored ABCB1 expression. Analysis of general expression revealed that aberrant CpG islands' hypermethylation of ABCB1 caused sensitivity to GC and induced changes in the proliferation and oxidative stress of MSC under GC administration. CONCLUSION: These data suggest that aberrant CpG islands' hypermethylation of ABCB1 gene may be responsible for individual differences in the development of GC-associated ONFH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,233

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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