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Enregistrement W2001866787 · doi:10.1007/s13361-013-0788-5

Rearrangements Leading to Fragmentations of Hydrocinnamate and Analogous Nitrogen-Containing Anions Upon Collision-Induced Dissociation

2014· article· en· W2001866787 sur OpenAlexafffund
Elizabeth A. L. Gillis, J. Stuart Grossert, Robert L. White

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society for Mass Spectrometry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAtlantic Canada Opportunities Agency
Mots-clésChemistryDissociation (chemistry)Collision-induced dissociationNitrogenFragmentation (computing)Computational chemistryCollisionMass spectrometryOrganic chemistryTandem mass spectrometryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tandem mass spectrometry (MS/MS) confirmed decarboxylation as the major collision-induced dissociation (CID) pathway of deprotonated hydrocinnamic acid (C6H5CH2CH2CO2H), N-phenylglycine (C6H5NHCH2CO2H) and 3-pyridin-2-ylpropanoic acid (C5H4NCH2CH2CO2H). The structure and stability of isomeric precursor and product anions were examined using density functional theory and ab initio methods. Geometry optimizations and frequency calculations were performed using the B3LYP/6-31++G(2d,p) level of theory and basis set with additional single point energies calculated at the MP2/6-311++G(2d,p) level. The formation of a delocalized product anion by carboxyl group-mediated migration of a benzylic proton to the ortho position of the ring and subsequent Cα-CO2(-) bond cleavage was energetically more favorable than direct decarboxylation and rearrangements of anions within ion-neutral complexes with carbon dioxide. The energy barrier for rearrangement of the delocalized product anion to the more stable benzylic anion was lowest in the fragmentation pathway of 3-pyridin-2-ylpropanoate. More energetically demanding fragmentation processes were indicated by the formation of other product anions at higher collision energy. Computations supported the feasibility of the formation of hydroxycarbonyl, styrene, and phenide ions from the benzylic anion of hydrocinnamate and the corresponding product anions from the nitrogen-containing analogues. The loss of dihydrogen from decarboxylated 3-pyridin-2-ylpropanoate was characterized computationally as hydride abstraction of an aryl proton. Overall, the results highlight the importance of exploring rearrangements in the fragmentation pathways of ions formed by electrospray ionization (ESI).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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