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Enregistrement W2001939347 · doi:10.1074/jbc.m109.033688

Structural Characterization of Clusterin-Chaperone Client Protein Complexes

2009· article· en· W2001939347 sur OpenAlexaboutno aff
Amy R. Wyatt, Justin J. Yerbury, Mark R. Wilson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClusterin in disease pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClusterinChemistryCircular dichroismChaperone (clinical)Protein aggregationFluorescenceBiochemistryProtein secondary structureDynamic light scatteringBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clusterin (CLU) is a potent extracellular chaperone that inhibits protein aggregation and precipitation otherwise caused by physical or chemical stresses (e.g. heat, reduction). This action involves CLU forming soluble high molecular weight (HMW) complexes with the client protein. Other than their unquantified large size, the physical characteristics of these complexes were previously unknown. In this study, HMW CLU-citrate synthase (CS), HMW CLU-fibrinogen (FGN), and HMW CLU-glutathione S-transferase (GST) complexes were generated in vitro, and their structures studied using size exclusion chromatography (SEC), ELISA, SDS-PAGE, dynamic light scattering (DLS), bisANS fluorescence, and circular dichroism spectrophotometry (CD). Densitometry of Coomassie Blue-stained SDS-PAGE gels indicated that all three HMW CLU-client protein complexes had an approximate mass ratio of 1:2 (CLU:client protein). SEC indicated that all three clients formed complexes with CLU>or=4x10(7) Da; however, DLS estimated HMW CLU-FGN to have a diameter of 108.57+/-18.09 nm, while HMW CLU-CS and HMW CLU-GST were smaller with estimated diameters of 51.06+/-6.87 nm and 52.61+/-7.71 nm, respectively. Measurements of bisANS fluorescence suggest that the chaperone action of CLU involves preventing the exposure to aqueous solvent of hydrophobic regions that are normally exposed by the client protein during heat-induced unfolding. CD analysis indicated that, depending on the individual client protein, CLU may interact with a variety of intermediates on protein unfolding pathways with different amounts of native secondary structure. In vivo, soluble complexes like those studied here are likely to serve as vehicles to dispose of otherwise dangerous aggregation-prone misfolded extracellular proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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