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Enregistrement W2001999390 · doi:10.1099/mic.0.063776-0

Isolation, characterization and complete genome sequence of PhaxI: a phage of Escherichia coli O157 : H7

2013· article· en· W2001999390 sur OpenAlexaff
Salehe Sabouri Shahrbabak, Zahra Khodabandehlou, Ahmad Reza Shahverdi, Mikael Skurnik, Hans‐Wolfgang Ackermann, Markku Varjosalo, Mojtaba Tabatabaei Yazdi, Zargham Sepehrizadeh

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColiphageEscherichia coliMyoviridaeBacteriophageBiologyVirulenceMicrobiologyGenomeCapsidLysisGeneDNAMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteriophages are considered as promising biological agents for the control of infectious diseases. Sequencing of their genomes can ascertain the absence of antibiotic resistance, toxin or virulence genes. The anti-O157 : H7 coliphage, PhaxI, was isolated from a sewage sample in Iran. Morphological studies by transmission electron microscopy showed that it has an icosahedral capsid of 85-86 nm and a contractile tail of 115×15 nm. PhaxI contains dsDNA composed of 156 628 nt with a G+C content of 44.5 mol% that encodes 209 putative proteins. In MS analysis of phage particles, 92 structural proteins were identified. PhaxI lyses Escherichia coli O157 : H7 in Luria-Bertani medium and milk, has an eclipse period of 20 min and a latent period of 40 min, and has a burst size of about 420 particles per cell. PhaxI is a member of the genus 'Viunalikevirus' of the family Myoviridae and is specific for E. coli O157 : H7.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,793
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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