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Enregistrement W2002005828 · doi:10.1111/j.1567-1364.2009.00563.x

Widespread occurrence of chromosomal aneuploidy following the routine production of<i>Candida albicans</i>mutants

2009· article· en· W2002005828 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFEMS Yeast Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMcGill UniversityBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyAneuploidyCandida albicansGeneticsChromosomeMutantCorpus albicansMultiplexMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It has come to our attention that approximately 35% of >100 published microarray datasets, where transcript levels were compared between two different strains, exhibit some form of chromosome-specific bias. While some of these arose from the use of strains whose aneuploidies were not known at the time, in a worrisome number of cases the recombinant strains have acquired additional aneuploidies that were not initially present in the parental strain. The aneuploidies often affected a different chromosome than the one harboring the insertion site. The affected strains originated from either CAI-4, RM1000, BWP17 or SN95 and were produced through a variety of strategies. These observations suggest that aneuploidies frequently occur during the production of recombinant strains and have an effect on global transcript profiles outside of the afflicted chromosome(s), thus raising the possibility of unintended phenotypic consequences. Thus, we propose that all Candida albicans mutants and strains should be tested for aneuploidy before being used in further studies. To this end, we describe a new rapid testing method, based on a multiplex quantitative PCR assay, that produces eight bands of distinct sizes from either the left or right arms of each C. albicans chromosome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,523
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle