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Enregistrement W2002038945 · doi:10.2500/ajra.2010.24.3429

Polymorphisms in the SERPINA1 (Alpha-1-Antitrypsin) Gene are Associated with Severe Chronic Rhinosinusitis Unresponsive to Medical Therapy

2010· article· en· W2002038945 sur OpenAlexaff
Shaun Kilty, Yohan Bossé, Chantale Cormier, Léandra Mfuna Endam, Martin Y. Desrosiers

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Rhinology and Allergy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSinusitis and nasal conditions
Établissements canadiensMcGill UniversityInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité de MontréalUniversité LavalHôtel-Dieu de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMedicineInternational HapMap ProjectPopulationAlpha 1-antitrypsin deficiencySNPSNP genotypingGeneticsImmunologyGenotypeBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Alpha-1-antitrypsin (AAT) is a serine protease inhibitor that blocks the protease, neutrophil elastase. Previous population studies have suggested that heterozygote status for the AAT gene (SERPINA1) is a risk factor for chronic rhinosinusitis with nasal polyposis (CRSwNP). This implies a potential genetic predisposition to CRS tied to AAT deficiency. The purpose of this study was to investigate the association between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the SERPINA1 gene and CRS. METHODS: DNA extracted from a population of 206 patients diagnosed with CRSwNPs and 196 postal code-matched controls was used. A maximally informative set of tagging SNPs from SERPINA1 on chromosome 14q were selected from the HapMap data set (International HapMap Consortium, Nature 437:1299-1320, 2005) and genotyped on the Sequenom platform (Sequenom, San Diego, CA). RESULTS: Successful genotyping was performed for 32 of 33 SNPs. Two SNPs (rs1243168 and rs4900229) located upstream of the SERPINA1gene, were associated with CRS. Individuals homozygous (TT) for these SNPs had an increased probability of having CRS with an odds ratio of 5.95 and 1.49, respectively. Subgroup analysis according to severity of disease identified each SNP to be increasingly common in individuals as disease severity increased (p < 0.001). These individuals were also less likely to be responsive to medical therapy (p < 0.001). CONCLUSION: Polymorphisms of the SERPINA1 gene are associated with clinically severe CRS. These results, from a small subset of individuals with CRS, suggest that defects in AAT may be implicated in a subset of individuals unresponsive to conventional therapy and suggests that alternate therapies may be required for their management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,341
Score d'incertitude au seuil0,472

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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