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Enregistrement W2002063618 · doi:10.1074/jbc.m009776200

Structure and Expression of the Murine Phosphatidylserine Synthase-1 Gene

2001· article· en· W2002063618 sur OpenAlexaff
Bénédicte Sturbois-Balcerzak, Scot J. Stone, Avula Sreenivas, Jean E. Vance

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésGeneGene expressionPhosphatidylserineBiologyATP synthaseGeneticsMolecular biologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In mammalian cells, phosphatidylserine is synthesized by two different enzymes, phosphatidylserine synthase (PSS)-1 and -2, via a base exchange reaction in which the head group of a phospholipid (phosphatidylcholine or phosphatidylethanolamine) is replaced by l-serine. Since the amino acid sequences of PSS1 and PSS2 are only approximately 30% identical, it is likely that they are encoded by different genes. We have screened a murine liver genomic DNA library, included in bacterial artificial chromosomes, with full-length murine PSS1 cDNA and isolated a clone containing the majority of the PSS1 gene. This gene spans approximately 35 kilobases and contains 13 exons and 12 introns. The sizes of the exons range from 44 to 1035 base pairs. The gene was localized to chromosome 13 in region B-C1. According to reverse transcriptase-mediated polymerase chain reaction, PSS1 and PSS2 mRNAs were expressed in all murine tissues examined. The mRNA encoding PSS1 was most abundant in kidney, brain, and liver, whereas PSS2 mRNA was most highly expressed in testis. In general agreement with the levels of mRNA expression, the choline exchange activity (contributed by PSS1, but not PSS2) was highest in brain, whereas serine and ethanolamine exchange activities were highest in testis and kidney. The transcriptional initiation site for PSS1 was identified 111 base pairs upstream of the ATG specifying the start of translation. The putative 5'-proximal promoter region of the gene contained no TATA or CAAT box, but did have a high GC content. Isolation of the murine PSS1 gene is a step toward generation of genetically modified mouse models that will help to understand the functions of PSS1 and PSS2 in animal biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,596

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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