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Enregistrement W2002114056 · doi:10.1002/elps.201400604

Multiplexed separations for biomarker discovery in metabolomics: Elucidating adaptive responses to exercise training

2015· article· en· W2002114056 sur OpenAlexafffund
Naomi L. Kuehnbaum, Jenna B. Gillen, Aleshia Kormendi, Karen P. Lam, Alicia DiBattista, Martin J. Gibala, Philip Britz‐McKibbin

Notice bibliographique

RevueElectrophoresis · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMetabolomicsHypoxanthineMetabolomeBiomarker discoveryChemistryInternal medicineMedicineProteomicsBiochemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High efficiency separations are needed to enhance selectivity, mass spectral quality, and quantitative performance in metabolomic studies. However, low sample throughput and complicated data preprocessing remain major bottlenecks to biomarker discovery. We introduce an accelerated data workflow to identify plasma metabolite signatures of exercise responsiveness when using multisegment injection-capillary electrophoresis-mass spectrometry (MSI-CE-MS). This multiplexed separation platform takes advantage of customizable serial injections to enhance sample throughput and data fidelity based on temporally resolved ion signals derived from seven different sample segments analyzed within a single run. MSI-CE-MS was applied to explore the adaptive metabolic responses of a cohort of overweight/obese women (BMI > 25, n = 9) performing a 6-wk high-intensity interval training intervention using a repeated measures/cross-over study design. Venous blood samples were collected from each subject at three time intervals (baseline, postexercise, recovery) in their naïve and trained states while completing standardized cycling trials at the same absolute workload. Complementary statistical methods were used to classify dynamic changes in plasma metabolism associated with strenuous exercise and training status. Positive adaptations to exercise were associated with training-induced upregulation in plasma l-carnitine at rest due to improved muscle oxidative capacity, and greater antioxidant capacity as reflected by lower circulating glutathionyl-l-cysteine mixed disulfide. Attenuation in plasma hypoxanthine and higher O-acetyl-l-carnitine levels postexercise also indicated lower energetic stress for trained women.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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