MétaCan
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Enregistrement W2002167434 · doi:10.1074/jbc.m101153200

The Folded Modules of Aggrecan G3 Domain Exert Two Separable Functions in Glycosaminoglycan Modification and Product Secretion

2002· article· en· W2002167434 sur OpenAlexaff
Liwen Chen, Yaojiong Wu, Vivian Lee, Chris Kiani, Mark E. Adams, Yeqi Yao, Burton B. Yang

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosaminoglycanAggrecanSecretionDomain (mathematical analysis)Product (mathematics)Separable spaceChemistryCell biologyBiochemistryMathematicsBiologyMedicineMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aggrecan is the major proteoglycan in the extracellular matrix of cartilage. A notable exception is nanomelic cartilage, which lacks aggrecan in its matrix. The example of nanomelia and other evidence leads us to believe that the G3 domain plays an important role in aggrecan processing, and it has indeed been confirmed that G3 allows glycosaminoglycan (GAG) chain attachment and product secretion. However, it is not clear how G3, which contains at least a carbohydrate recognition domain (CRD) and a complement binding protein (CBP) motif, plays these two functional roles. The present study was designed to dissect the mechanisms of this phenomenon and specially 1) to determine the effects of various cysteine residues in GAG modification and product secretion as well as 2) to investigate which of the two processing events is the critical step in the product processing. Our studies demonstrated that removal of the two amino-terminal cysteines in the CRD motif and the single cysteine in the amino terminus of CBP inhibited secretion of CRD and CBP. Use of the double mutant CRD construct also allowed us to observe a deviation from the usual strict coupling of GAG modification and product secretion steps. The presence of a small chondroitin sulfate fragment overcame the secretion-inhibitory effects once the small chondroitin sulfate fragment was modified by GAG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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