Position-Dependent Hydrophobicity of the Antimicrobial Magainin Peptide Affects the Mode of Peptide−Lipid Interactions and Selective Toxicity
Notice bibliographique
Résumé
Cationic antimicrobial peptides are promising candidates as novel antibiotics of clinical usefulness. Magainin 2, a representative antimicrobial peptide isolated from the skin of the African clawed frog Xenopus leavis, electrostatically recognizes anionic lipids that are abundant in bacterial membranes, forming a peptide-lipid supramolecular complex pore, whereas the peptide does not effectively bind to zwitterionic phospholipids constituting the outer leaflets of mammalian cell membranes because of the low hydrophobicity of the peptide [Matsuzaki, K. (1999) Biochim. Biophys. Acta 1462, 1-10]. In this study, two magainin analogues with enhanced hydrophobicity, MG-H1 (GIKKFLHIIWKFIKAFVGEIMNS) and MG-H2 (IIKKFLHSIWKFGKAFVGEIMNI), with identical amino acid compositions were designed and interactions with lipid bilayers and biological activities were examined in comparison with those of MG (GIGKWLHSAKKFGKAFVGEIMNS = F5W-magainin 2). The apparent hydrophobicities and hydrophobic moments of MG-H1 and MG-H2, conventionally calculated assuming that all residues are involved in helix formation, were almost the same. MG-H2 behaved like MG except for greatly enhanced activity against zwitterionic membranes and erythrocytes. In contrast, despite a very similar calculated hydrophobicity, the observed hydrophobicity of MG-H1 was larger than that of MG-H2 because of a tendency toward helix fraying near the termini. Therefore, the physicochemical parameters of only the helical portion should be considered in characterizing peptide-lipid interactions, although this point was overlooked in most studies. Moreover, MG-H1 induced aggregation and/or fusion of negatively charged membranes. Furthermore, the peptide hydrophobicity was found to affect pore formation rate, pore size, and pore stability. These observations demonstrate that the hydrophobicity of the peptide also controls the mode of action and is dependent on the position of the hydrophobic amino acids in the peptide sequence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
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