FlaK of the archaeon<i>Methanococcus maripaludis</i>possesses preflagellin peptidase activity.
Notice bibliographique
Résumé
Archaeal flagellins are initially synthesized as preflagellins with a short, positively charged leader peptide, which is cleaved prior to the incorporation of the mature flagellins into the filament. While preflagellin peptidase activity had previously been detected in methanogen membranes, the enzyme responsible for this activity had not been identified. We show here that FlaK of Methanococcus maripaludis has preflagellin peptidase activity. In an in vitro preflagellin peptidase assay, Escherichia coli membranes overexpressing Methanococcus voltae preflagellin FlaB2 (as substrate) were combined with E. coli membranes overexpressing M. maripaludis FlaK (as enzyme). Cleavage of the preflagellin was demonstrated by immunoblotting using antibody to FlaB2 and detection of a faster migrating cross-reactive species. This activity required detergent in the assay, and was not detected in membranes previously heated to 95 degrees C. This is the first reported identification of the preflagellin peptidase, and aside from the flagellins, this is the first assignment of function to a gene involved in archaeal flagellation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».