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Enregistrement W2002463479 · doi:10.1186/s12866-014-0225-3

The presence of nitrate dramatically changed the predominant microbial community in perchlorate degrading cultures under saline conditions

2014· article· en· W2002463479 sur OpenAlex
Victor G. Stepanov, Yeyuan Xiao, Quyen Tran, Mark Rojas, Richard C. Willson, Yuriy Fofanov, George E. Fox, Deborah J. Roberts

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueChemical Analysis and Environmental Impact
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of British ColumbiaGeorgia Institute of TechnologyWelch FoundationNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésPerchlorateNitrateBrineBiologyChlorateMicrobiologyEnvironmental chemistryEcologyChemistryInorganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Perchlorate contamination has been detected in both ground water and drinking water. An attractive treatment option is the use of ion-exchange to remove and concentrate perchlorate in brine. Biological treatment can subsequently remove the perchlorate from the brine. When nitrate is present, it will also be concentrated in the brine and must also be removed by biological treatment. The primary objective was to obtain an in-depth characterization of the microbial populations of two salt-tolerant cultures each of which is capable of metabolizing perchlorate. The cultures were derived from a single ancestral culture and have been maintained in the laboratory for more than 10 years. One culture was fed perchlorate only, while the other was fed both perchlorate and nitrate. RESULTS: A metagenomic characterization was performed using Illumina DNA sequencing technology, and the 16S rDNA of several pure strains isolated from the mixed cultures were sequenced. In the absence of nitrate, members of the Rhodobacteraceae constituted the prevailing taxonomic group. Second in abundance were the Rhodocyclaceae. In the nitrate fed culture, the Rhodobacteraceae are essentially absent. They are replaced by a major expansion of the Rhodocyclaceae and the emergence of the Alteromonadaceae as a significant community member. Gene sequences exhibiting significant homology to known perchlorate and nitrate reduction enzymes were found in both cultures. CONCLUSIONS: The structure of the two microbial ecosystems of interest has been established and some representative strains obtained in pure culture. The results illustrate that under favorable conditions a group of organisms can readily dominate an ecosystem and yet be effectively eliminated when their advantage is lost. Almost all known perchlorate-reducing organisms can also effectively reduce nitrate. This is certainly not the case for the Rhodobacteraceae that were found to dominate in the absence of nitrate, but effectively disappeared in its presence. This study is significant in that it reveals the existence of a novel group of organisms that play a role in the reduction of perchlorate under saline conditions. These Rhodobacteraceae especially, as well as other organisms present in these communities may be a promising source of unique salt-tolerant enzymes for perchlorate reduction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,493
Score d'incertitude au seuil0,488

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle