Topology of transmembrane segments 1–4 in the human chloride/bicarbonate anion exchanger 1 (AE1) by scanning N-glycosylation mutagenesis
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Notice bibliographique
Résumé
Human AE1 (anion exchanger 1), or Band 3, is an abundant membrane glycoprotein found in the plasma membrane of erythrocytes. The physiological role of the protein is to carry out chloride/bicarbonate exchange across the plasma membrane, a process that increases the carbon-dioxide-carrying capacity of blood. To study the topology of TMs (transmembrane segments) 1-4, a series of scanning N-glycosylation mutants were created spanning the region from EC (extracellular loop) 1 to EC2 in full-length AE1. These constructs were expressed in HEK-293 (human embryonic kidney) cells, and their N-glycosylation efficiencies were determined. Unexpectedly, positions within putative TMs 2 and 3 could be efficiently glycosylated. In contrast, the same positions were very poorly glycosylated when present in mutant AE1 with the SAO (Southeast Asian ovalocytosis) deletion (DeltaA400-A408) in TM1. These results suggest that the TM2-3 region of AE1 may become transiently exposed to the endoplasmic reticulum lumen during biosynthesis, and that there is a competition between proper folding of the region into the membrane and N-glycosylation at introduced sites. The SAO deletion disrupts the proper integration of TMs 1-2, probably leaving the region exposed to the cytosol. As a result, engineered N-glycosylation acceptor sites in TM2-3 could not be utilized by the oligosaccharyltransferase in this mutant form of AE1. The properties of TM2-3 suggest that these segments form a re-entrant loop in human AE1.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle