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Enregistrement W2002649329 · doi:10.1021/bi9929958

Multiple Replacements of Glutamine 143 in Human Manganese Superoxide Dismutase:  Effects on Structure, Stability, and Catalysis

2000· article· en· W2002649329 sur OpenAlex
Vincent Lévêque, M. Elizabeth Stroupe, James R. Lepock, Diane E. Cabelli, John A. Tainer, Harry S. Nick, David N. Silverman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMetal-Catalyzed Oxygenation Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésChemistryActive siteSuperoxide dismutaseManganeseStereochemistryCatalysisRadiolysisEnzymeDissociation (chemistry)CrystallographyPhotochemistryRadicalBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutamine 143 in human manganese superoxide dismutase (MnSOD) forms a hydrogen bond with the manganese-bound solvent molecule and is investigated by replacement using site-specific mutagenesis. Crystal structures showed that the replacement of Gln 143 with Ala made no significant change in the overall structure of the mutant enzyme. Two new water molecules in Q143A MnSOD were situated in positions nearly identical with the Oepsilon1 and Nepsilon2 of the replaced Gln 143 side chain and maintained a hydrogen-bonded network connecting the manganese-bound solvent molecule to other residues in the active site. However, their presence could not sustain the stability and activity of the enzyme; the main unfolding transition of Q143A was decreased 16 degrees C and its catalysis decreased 250-fold to k(cat)/K(m) = 3 x 10(6) M(-)(1) s(-)(1), as determined by stopped-flow spectrophotometry and pulse radiolysis. The mutant Q143A MnSOD and other mutants at position 143 showed very low levels of product inhibition and favored Mn(II)SOD in the resting state, whereas the wild type showed strong product inhibition and favored Mn(III)SOD. However, these differences did not affect the rate constant for dissociation of the product-inhibited complex in Q143A MnSOD which was determined from a characteristic absorbance at 420 nm and was comparable in magnitude ( approximately 100 s(-)(1)) to that of the wild-type enzyme. Hence, Gln 143, which is necessary for maximal activity in superoxide dismutation, appears to have no role in stabilization and dissociation of the product-inhibited complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle