MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2002770009 · doi:10.1371/journal.pone.0048773

Targeting of CRMP-2 to the Primary Cilium Is Modulated by GSK-3β

2012· article· en· W2002770009 sur OpenAlexafffund
Young Ou, Ying Zhang, Min Cheng, J. B. Rattner, Ina Dobrinski, Frans A. van der Hoorn

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesOffice of Research Infrastructure Programs, National Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCiliumCell biologyBasal bodyBiologyPhosphorylationIntraflagellar transportMicrotubuleMotile ciliumGene knockdownMolecular biologyChemistryMutantGeneticsCell cultureGeneFlagellum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CRMP-2 plays a pivotal role in promoting axon formation, neurite outgrowth and elongation in neuronal cells. CRMP-2's role in other cells is unknown. Our preliminary results showed CRMP-2 expression in cilia of fibroblasts. To localize CRMP-2, define its role and study the regulation of CRMP-2's expression in cilia we carried out the following experiments. We find that in fibroblasts CRMP-2 localizes to the centrosome and is associated with the basal body and -at a low level- is present in primary cilia. Phosphorylated pCRMP-2 can only be detected at the basal body. RNAi knockdown of CRMP-2 interfered with primary cilium assembly demonstrating a critical requirement for CRMP-2. Deletion analysis of CRMP-2 identified a 51 amino acid sequence in the C-terminus that is required for targeting to the basal body and primary cilium. This domain contains GSK-3β phosphorylation sites as well as two repeats of the VxPx motif, previously identified as a cilium targeting signal in other primary cilium proteins. To our surprise, mutation of the CRMP-2 VxPx motifs did not eliminate primary cilium targeting. Instead, mutation of the GSK-3β phosphorylation sites abolished CRMP-2 targeting to the primary cilium without affecting basal body localization. Treatment of cells with lithium, a potent GSK-3β inhibitor, or with two specific GSK-3β inhibitors (the L803-mts peptide inhibitor and CHIR99021) resulted in cilium elongation and decreased basal body levels of pCRMP-2 as well as increased levels of total CRMP-2 at the primary cilium. In summary, we identified CRMP-2 as a protein critically involved in primary cilia formation. To our knowledge this is the first demonstration of modulation of primary cilium targeting by GSK-3β.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetGenetic and Kidney Cyst DiseasesTravaux en français237 207