MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2002912012 · doi:10.1111/j.1399-0004.2007.00855.x

<i>CYR61 </i>polymorphisms are associated with plasma HDL‐cholesterol levels in obese individuals

2007· article· en· W2002912012 sur OpenAlexafffund
Luigi Bouchard, André Tchernof, Yves Deshaies, S Lebel, F‐S Hould, P Marceau

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective Tissue Growth Factor Research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité LavalHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésInternal medicineEndocrinologyMetabolic syndromeCholesterolAlleleBiologyObesityMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have recently characterized the transcriptome of the omental adipose tissue of non-diabetic, obese men with and without the metabolic syndrome (MS). The cysteine-rich protein 61 (CYR61) is one of the most differentially expressed genes between the groups and has been selected for a detailed molecular investigation. Direct sequencing of complete CYR61 gene revealed five polymorphisms with minor allele frequency >5% in the promoter region (rs 3753794, rs 3753793 and rs 2297140), intron 1 (rs 2297141) and intron 2 (IVS 2+50). Chi-square test and logistic regression were applied to test for association between CYR61 polymorphisms and the individual MS components in a cohort of 697 obese individuals. In men and women, rs 3753794 and rs 3753793 (r2 = 0.77) were associated plasma HDL-cholesterol levels (p = 0.016 and p = 0.008). Carriers of the A allele for rs 3753794 were more likely to have high plasma HDL-cholesterol levels (1.50-fold; p = 0.016), as compared with G/G homozygotes and the A/A homozygotes for rs 3753793 were more likely to exhibit low plasma HDL-cholesterol levels (1.56-fold; p = 0.008), as compared with C/C homozygotes. Furthermore, an association between IVS 2+50 polymorphism and HDL-cholesterol was found in women and in men analyzed separately (p = 0.002 and p = 0.038, respectively). These results suggest that CYR61 is a promising candidate gene for lipoprotein/lipid perturbations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical GeneticsMême sujetConnective Tissue Growth Factor ResearchTravaux en français237 207