<i>CYR61 </i>polymorphisms are associated with plasma HDL‐cholesterol levels in obese individuals
Notice bibliographique
Résumé
We have recently characterized the transcriptome of the omental adipose tissue of non-diabetic, obese men with and without the metabolic syndrome (MS). The cysteine-rich protein 61 (CYR61) is one of the most differentially expressed genes between the groups and has been selected for a detailed molecular investigation. Direct sequencing of complete CYR61 gene revealed five polymorphisms with minor allele frequency >5% in the promoter region (rs 3753794, rs 3753793 and rs 2297140), intron 1 (rs 2297141) and intron 2 (IVS 2+50). Chi-square test and logistic regression were applied to test for association between CYR61 polymorphisms and the individual MS components in a cohort of 697 obese individuals. In men and women, rs 3753794 and rs 3753793 (r2 = 0.77) were associated plasma HDL-cholesterol levels (p = 0.016 and p = 0.008). Carriers of the A allele for rs 3753794 were more likely to have high plasma HDL-cholesterol levels (1.50-fold; p = 0.016), as compared with G/G homozygotes and the A/A homozygotes for rs 3753793 were more likely to exhibit low plasma HDL-cholesterol levels (1.56-fold; p = 0.008), as compared with C/C homozygotes. Furthermore, an association between IVS 2+50 polymorphism and HDL-cholesterol was found in women and in men analyzed separately (p = 0.002 and p = 0.038, respectively). These results suggest that CYR61 is a promising candidate gene for lipoprotein/lipid perturbations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».