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Enregistrement W2002929100 · doi:10.1160/th07-10-0645

Allosteric regulation of αIIbβ3 by β3 95–105

2008· article· en· W2002929100 sur OpenAlexafffund
Thomas A. Haas

Notice bibliographique

RevueThrombosis and Haemostasis · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica
Mots-clésAllosteric regulationMedicineChemistryNeuroscienceInternal medicineBiologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The linear recognition sequences of an anti-beta(3) antibody that blocked platelet aggregation were identified using beta(3) tryptic peptides. Two of these recognition sequence-containing peptides were mapped to beta(3) 92-105, and antibodies affinity purified using these peptides blocked platelet aggregation. Examining the structure of alpha(IIb)beta(3) identified beta(3) 95-105 as the solvent accessible sequence within beta(3) 92-105. A peptide corresponding to beta(3) 95-105 was synthesized and used to affinity purify the beta(3) antibody. Anti-beta(3) 95-105 completely blocked platelet aggregation and agonist-induced fibrinogen binding to platelets, but had no effect on cyclic-RGD binding. Binding of anti-beta(3) 95-105 to alpha(IIb)beta(3) also did not alter the structure of the alpha(IIb) cap subdomain, as measured by anti-alpha(IIb) 201-217 binding. beta(3) 95-105 and peptides spanning two adjacent sequences in the structure of beta(3) did not bind fibrinogen and were ineffectual in blocking agonist-induced platelet aggregation. Structure analysis revealed that beta(3) 95-105 is adjacent to one of the two hinges in beta(3) that allows for the outward swing of the hybrid and PSI domains which is central to the conversion of alpha(IIb)beta(3) from a low into a high affinity state. Thus, the binding of an antibody to beta(3) 95-105 could serve as a fulcrum for allosteric regulation of alpha(IIb)beta(3) by regulating the movement of the hybrid-PSI domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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