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Enregistrement W2002950258 · doi:10.1371/journal.ppat.1002485

The bZIP Transcription Factor Rca1p Is a Central Regulator of a Novel CO2 Sensing Pathway in Yeast

2012· article· en· W2002950258 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésAdenylyl cyclaseTranscription factorBiologyRegulatorCell biologyCandida albicansSaccharomyces cerevisiaeYeastcAMP-dependent pathwayResponse regulatorSignal transductionTranscriptional regulationBiochemistryGeneticsGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Like many organisms the fungal pathogen Candida albicans senses changes in the environmental CO(2) concentration. This response involves two major proteins: adenylyl cyclase and carbonic anhydrase (CA). Here, we demonstrate that CA expression is tightly controlled by the availability of CO(2) and identify the bZIP transcription factor Rca1p as the first CO(2) regulator of CA expression in yeast. We show that Rca1p upregulates CA expression during contact with mammalian phagocytes and demonstrate that serine 124 is critical for Rca1p signaling, which occurs independently of adenylyl cyclase. ChIP-chip analysis and the identification of Rca1p orthologs in the model yeast Saccharomyces cerevisiae (Cst6p) point to the broad significance of this novel pathway in fungi. By using advanced microscopy we visualize for the first time the impact of CO(2) build-up on gene expression in entire fungal populations with an exceptional level of detail. Our results present the bZIP protein Rca1p as the first fungal regulator of carbonic anhydrase, and reveal the existence of an adenylyl cyclase independent CO(2) sensing pathway in yeast. Rca1p appears to regulate cellular metabolism in response to CO(2) availability in environments as diverse as the phagosome, yeast communities or liquid culture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,320

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle