Genetic Interactions of <i>DST1</i> in <i>Saccharomyces cerevisiae</i> Suggest a Role of TFIIS in the Initiation-Elongation Transition
Notice bibliographique
Résumé
TFIIS promotes the intrinsic ability of RNA polymerase II to cleave the 3'-end of the newly synthesized RNA. This stimulatory activity of TFIIS, which is dependent upon Rpb9, facilitates the resumption of transcription elongation when the polymerase stalls or arrests. While TFIIS has a pronounced effect on transcription elongation in vitro, the deletion of DST1 has no major effect on cell viability. In this work we used a genetic approach to increase our knowledge of the role of TFIIS in vivo. We showed that: (1) dst1 and rpb9 mutants have a synthetic growth defective phenotype when combined with fyv4, gim5, htz1, yal011w, ybr231c, soh1, vps71, and vps72 mutants that is exacerbated during germination or at high salt concentrations; (2) TFIIS and Rpb9 are essential when the cells are challenged with microtubule-destabilizing drugs; (3) among the SDO (synthetic with Dst one), SOH1 shows the strongest genetic interaction with DST1; (4) the presence of multiple copies of TAF14, SUA7, GAL11, RTS1, and TYS1 alleviate the growth phenotype of dst1 soh1 mutants; and (5) SRB5 and SIN4 genetically interact with DST1. We propose that TFIIS is required under stress conditions and that TFIIS is important for the transition between initiation and elongation in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».