Detection and Partial Characterization of a Second Closterovirus Associated with Little Cherry Disease, Little cherry virus-2
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Little cherry disease (LChD) is a complex and serious viral disease of cherry. Although originally described almost 70 years ago, there has been little progress in identifying the causal agent of the disease due to the difficulty in obtaining purified virus from infected trees. This problem was partially overcome in 1997 when the compete sequence of a closterovirus associated with LChD, Little cherry virus (LChV), was published. This virus could be associated with some, but not all, trees with LChD, indicating that another virus was also involved. We report here the partial characterization of a second closterovirus associated with LChD, Little cherry virus-2 (LChV-2), and in order to differentiate the two LChD-associated viruses, we refer to LChV as Little cherry virus-1 (LChV-1). LChV-2 is a new closterovirus with molecular similarities to Grapevine leafroll-associated virus-1 (GLRaV-1) and GLRaV-3 but only distantly related to LChV-1. Based on limited sequence comparisons, LChV-2 is the same virus previously identified in association with LChD in Canada. In reverse transcription-polymerase chain reaction detection assays using specific oligonucleotide primers to either LChV-1 or LChV-2, 27 of 28 isolates of LChD tested positive to one or both of these viruses originating from Europe and North America. These results would further confirm the association of LChV-2 with LChD. One isolate, however, tested negative to both LChV-1 and LChV-2, indicating that while this report brings us a step closer to understanding LChD, further work is required to confirm the causal agents of LChD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».