MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2003092871 · doi:10.1139/w04-028

Pyrimidine nucleotide synthesis in<i>Pseudomonas</i><i>citronellolis</i>

2004· article· en· W2003092871 sur OpenAlexvenueno aff
Thomas P. West

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSouth Dakota Agricultural Experiment Station
Mots-clésAspartate carbamoyltransferasePyrimidine metabolismBiochemistryDerepressionUracilPyrimidineOrotic acidEnzymeCatabolite repressionEnzyme assayBiologyBiosynthesisEnzyme RepressionAuxotrophyMutantDNAPurinePsychological repressionAllosteric regulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pyrimidine biosynthesis was active in Pseudomonas citronellolis ATCC 13674 and appeared to be regulated by pyrimidines. When wild-type cells were grown on succinate in the presence of uracil, the de novo enzyme activities were depressed while only four enzyme activities were depressed in the glucose-grown cells. On either carbon source, orotic acid-grown cells had diminished aspartate transcarbamoylase, dihydroorotase or OMP decarboxylase activity. Pyrimidine limitation of glucose-grown pyrimidine auxotrophic cells resulted in de novo enzyme activities, except for transcarbamoyolase activity, that were elevated by more than 5-fold compared to their activities in uracil-grown cells. Since pyrimidine limitation of succinate-grown mutant cells produced less enzyme derepression, catabolite repression appeared to be a factor. At the level of enzyme activity, aspartate transcarbamoylase activity in P. citronellolis was strongly inhibited by all effectors tested. Compared to the regulation of pyrimidine biosynthesis in taxonomically-related species, pyrimidine biosynthesis in P. citronellolis appeared more highly regulated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of MicrobiologyMême sujetBiochemical and Molecular ResearchTravaux en français237 207