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Enregistrement W2003200202 · doi:10.1136/jmg.2010.087361

What did we learn from the genome-wide association study for tuberculosis susceptibility?: Figure 1

2011· article· en· W2003200202 sur OpenAlexaff
Hui‐Qi Qu, Quan Li, Joseph B. McCormick, Susan P. Fisher‐Hoch

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesWellcome Trust
Mots-clésGenome-wide association studyConcordanceTuberculosisGenetic associationMycobacterium tuberculosisGeneticsPopulationTuberculinMedicineBiologySingle-nucleotide polymorphismGenotypeGeneEnvironmental healthPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetics literature is replete with results of candidate-gene association studies published mostly before the genome-wide association study (GWAS) became the new standard, but also continuing to this date. Their track record for replication is generally poor and discrepancies are typically attributed to differences in populations or environments. Are these results of any value, or should they be summarily discarded? Recent results from a GWAS for tuberculosis (TB) provide data that might put this question in perspective.1 TB is a serious health issue in the developing world, due to infection by Mycobacterium tuberculosis (MTB). Currently, about one third of the world's population is infected by MTB and 1/10 will develop active TB (http://www.who.int/tb/en/). Improved understanding of mechanisms of pathogenesis and host resistance is essential for improved control of TB. Human genetics is an indispensable tool for enhancing the understanding of the molecular basis of many common diseases. There is evidence that genetic factors may be involved in susceptibility to TB infection and activation of TB. This can be demonstrated by the fact of obvious ethnic differences. Blacks have about 1.5–2-fold greater risk than whites as shown by the tuberculin skin test,2 and concordance for TB is 2.5-fold higher among monozygotic than dizygotic …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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